MEGA：系統樹（進化樹）的構建

主要用於進化分析獲得的序列資訊。通過它可以編輯序列的資料、進行序列的比對、構建系統發育樹和推測對比物種序列間的關聯程度及進化距離等。

操作方法

（01）首先在NCBI等文獻搜尋軟體中搜索目的序列，此處以端粒telomere為例，開啟其中一個搜尋結果

（02）點選右邊的Run BLAST進行比對

（03）注意，如果此處輸入的是序列，右邊的序列比對範圍無法設定，如果是編號可以設定，這裡我設定的是從1到200個核酸比對

（04）比對的結果及其詳細資訊就是下面這樣（三幅圖是連在一起的）。這裡我選擇了前十個對比序列

（05）在Donwload下設定下載的文字格式，點選Continue進行下載，設定好儲存路徑。儲存好以後將文字開啟，格式設定為自動換行

（06）開啟MEGA，建立比對框。根據自己的需要選擇選項，點選OK。如果需要比對的是核酸，點選DNA，如果是蛋白質點選Protein

（07）點選比對框中Edit選單下的Insert Sequence From File；選擇自己之前下載的序列格式，因為我剛才的是Text文字格式，所以這裡我選擇Text（注意：如果格式不正確，則之前儲存的序列不會出現）。選好格式後，自己的核酸序列文字顯示出來，點選後開啟

（08）開啟後MEGA進行序列比對分析，根據比對結果可通過Edit對序列進行編輯

（09）分析好後點擊Date選單下的Phylogentic Analysis進行構象樹分析

（10）然後在主選單上點選Analysis點選Phylogeny，在選擇第二個選項並確定。點選Compute進行比對構建構象樹

（11）下面是比對的結果